FCディスクとSASディスク、性能的に違いがあるのでしょうか？

他のベンダーからディスク性能的には、さほど変らないという話をよく聞きます。

プロトコル的には、FCの方がオーバーヘッドがあるのですが

大容量ストレージに発展する場合は、SCSI IDとかの関係上

やはりFCでなければならないという結論になります。